(一)贯彻执行党和国家有关科技工作的方针、政策和法律法规，研究拟定本市科技发展和科技促进经济与社会发展的政策规定。
(二)研究提出科技发展的优先领域，组织制定本市科技发展战略；编制并组织实施本市科学技术发展中长期规划和年度计划。
(三)合理配置科技经费；负责归口管理本市级科学事业费、“科技三项费用”等有关经费的使用。
(四)研究制定促进高新技术及其产业化的政策措施并组织实施；指导科技成果转化；申报济宁市级以上各级各类科技计划并组织实施；参与指导农业高新技术开发示范及产业结构调整工作；负责本市民营科技企业认定及管理；组织申报济宁市级以上高新技术企业和高新技术转化项目，参与管理高新技术风险投资。
(五)归口管理科技成果、科技奖励、科技保密、技术市场和科技信息市场；协调组织与科技相关的知识产权保护工作；负责＜中华人民共和国合同法＞中有关技术合同规定的实施和监督检查。有关知识产权管理工作委托市知识产权局承担。
(六)归口管理本市科技外事工作，组织开展对外科技合作与交流，协同有关部门组织技术出口和重大技术引进、消化、创新工作。
(七)负责科技宣传、科技信息的管理工作；参与制定本市科学技术及工作规划，统筹协调全市科普工作；指导科技咨询、招标、评估等科技中介服务机构的工作；负责科技统计工作。
(八)协同有关部门研究有关科技人员的政策；协同有关部门做好本市科技人员的教育培训工作。
(九)负责济宁市级以上自然科学基金项目、中青年科技发展基金项目的申报管理工作；会同有关部门，负责济市级以上科技型中小企业创新发展专项扶持资金的申报管理。
(十)负责协调本市防震减灾工作。
(十一)指导协调本市防震减灾工作。
(十二)承办市科技工作领导小组的日常工作。
(十三)承办市委、市政府交办的其事项。